云层不同颜色的变化与光的折射率不同有关。
可见光中，波长最长是红色，其次是橙，黄，绿，蓝，紫。而有个规律，波长较短的较容易散射，波长较长的不容易散射。在早上，有时会看到红色的云，是因为阳光从大气层进入地球表面时，是斜着进入，所以经过大气层的时间较长，波长短的早就在空中被散射了，剩下红色或橙色留在云层。而在中午，阳光直接进入地球表面，经过大气层的时间较短，所以就会看到蓝色。而傍晚与早上相似。但是在早上也会看到蓝色，是因为阳光进入大气层是，经过的路线的云层，尘埃较少，所以被散射的也就少，所以就能够进入我们的眼睛。
