分辨猫咪公母最直接的就是看生殖器官，猫咪尾巴根下面有两个孔，靠近尾巴根的是肛门，另一个是生殖器口。母猫的两口之间距离近，大约1cm，外生殖器开口呈三角形或较扁，类似“水滴形状”，像倒过来的感叹号;公猫两口之间的长，大约2cm，主要是为将来睾丸下坠提供位置，外生殖器口呈圆形或近似于圆形，看上去像一个冒号。
有时候可能因为猫咪太小，生殖器官不明显，或公猫已做绝育，没有了睾丸，那么从脸部特征和体型也可以区分公母。成年公猫头大，头型方正，颧骨高，大腮帮子，大鼻头，胡须粗壮，体型较大，容易发胖，看起来健壮魁梧。母猫相反，头小，嘴巴尖，胡须细，小鼻头，体型相对较小，不太容易长胖，就是纤纤弱弱的。当然也会有例外情况。
还有一种特殊情况就是看花色，三花猫通常都是雌性，也就是说三种颜色的猫一般是母猫。这需要从遗传基因方面来解释，因为猫的颜色是伴性遗传，它的X染色体决定毛色是红还是黑，母猫有两个X染色体，公猫有一个X染色体，加上白色，就是母猫可以是三色，公猫只能是两色。
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