转录组测序如今的价格已经降到600以下了!但对于没有接触过生信的同学,拿着一堆公司给的流程化数据,分分钟头大,根本看不懂,售后服务也不满意!!本来想着从这些辛辛苦苦准备的实验材料中挖掘出什么有用的信息,给文章添彩,测完却成了鸡肋数据,还占着硬盘空间。怎样才能打破这种信息差?怎么才能学会生信秘技,利用转录组数据,自己也画出高大上的图像,找到关键的基因和转录因子,让导师和同学从此离不开你?现在,它来咯!!!
主办平台
科研日精进课堂
授课形式
7天直播课 每天答疑 无限回放
开课时间
每天答疑,0基础可掌握
提供高性能服务器配合练习
转录组完整分析流程和研究思路
赠Linux、R、Perl三门基础课程
课程插图
课程安排
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第1天 转录组概述
1.转录组实验流程和建库测序技术介绍
2.转录组分析方法介绍
3.转录组文章思路分享
4.如何下载公共数据库测序数据
5.转录组测序数据上传NCBI实操
第2天 数据比对和组装
1.转录组数据质量评估
2.参考基因组下载及使用
3.转录组数据比对(有参)
4.转录组数据组装(无参)
5.转录组数据不基于比对直接定量
第3天 差异表达分析
1.样品关联分析
2.基因表达量计算
3.DESeq2差异基因分析
4.韦恩图绘制
5.热图绘制
6.火山图绘制
第4天 基因功能分析
1.常用数据库介绍(NR、Swissprot、KOG/COG、Pfam)
2.EggNOG基因功能注释
3.GO功能分类分析
4.GO功能富集分析
5.KEGG功能分类分析
6.KEGG功能富集分析
7.GO富集分析结果展现(热图、气泡图、网络图)
8.KEGG通路基因热图展现(将基因热图放在代谢通路中)
9.GSEA富集分析和结果可视化
第5天 转录组数据深度分析
1.转录组趋势分析
2.转录因子分析
3.突变位点分析
4.可变剪切分析
5.蛋白质互作网络分析
6.转录组高通量比对数据可视化:IGV、SashimiPlot
第6天 基因网络分析
1.如何筛选表型相关的通路与基因
2.WGCNA基因共表达分析
3.WGCNA性状关联加权网络分析
4.Cytoscape绘制个性化网络图
第7天 个性化数据挖掘(无需代码)
1.转录组数据挖掘重要分析点
2.转录组文章常用套路讲解
3.转录组个性化图像绘制(聚类分析、韦恩图、PCA图、热图、火山图)
4.基于转录组的多组学关联分析(转录组 表观、转录组 蛋白、转录组 代谢)
5.基于转录组的多组学数据展现(桑基图、四象限图、九象限图)
6.转录组SCI图像组图及美化技巧(AI软件)
课程介绍
平台
"科研日精进课堂"是一个广大科研人员学习提高生物信息分析能力,获取最新生信技巧和资讯的活跃平台。
讲师
小宇老师公众号“科研日精进”生信区主要作者
“术”和“道”均有所长,尤其擅长R、Perl、Python等编程语言。2018年开始做生信培训,至今以R语言、转录组和代谢组等为主题开展了多场生信培训。目前已开发了包含转录组、代谢组和蛋白组等分析在内的十几款生物信息分析软件,并取得17项软件著作权,将把多年在生信领域“踩坑”和“爬坑”的经历毫无保留地分享。
学习
1. PC 端:学员可以在PC端进行学习,方法是在网站"www.keyandaydayup.com"中点击视频课。
2. 微信端:在公众号“科研日精进课堂”点击视频课-直播课。
3. 课程在两年内均可以无限次回放。
答疑
1. 直播期间,学员可以在屏幕上提问,主要是以文字形式提问,讲师会及时解答学员的问题。
2. 答疑期间,学员可以共享自己的屏幕并语音互动,讲师帮助解决学员遇到的问题。
3. 课程结束,学员可以继续参加每周的答疑活动,获得终生答疑。我们坚持,报名一次,服务终生,保证让您掌握所有的知识。
缴费
1. 推荐直接线上购买课程;
2. 若需对公转账,可先拍下课程,然后课程助理会与您沟通,我们会在单位转账完成后退还费用。
发票
可提供培训、会议通知或合同等,发票可开会议注册费、测试分析费等内容。
培训费用
2600元/人
拼团优惠300元,2人成团
报名方式
2. 收到报名信息,我们会电话或微信与您沟通
3. 课程助理会根据您要求提供合同、会议通知(邀请函)、发票等,发票明细可开培训费、会议费、技术服务费、测序分析费等。
报名入口
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